OCCURRENCE

Improving knowledge of Asian pteridophytes through DNA sampling of specimens in regional collections

Последняя версия опубликована Taiwan Forestry Research Institute 23 февраля 2023 г. Taiwan Forestry Research Institute
The ferns, lycophytes and seed-free vascular plants commonly described as pteridophytes exhibit hyperdiversity in the insular vegetation that often characterizes Asian floras. Despite harboring biodiversity hotspots, these plants and their georegions have been poorly surveyed, particularly in Southeast Asia, where one third of the world's pteridophyte species are concentrated. More than 60 per cent of the approximately 4,500 species lack georeferenced records in GBIF and only 6 per cent have been DNA barcoded.... Больше
Дата публикации:
23 февраля 2023 г.
Техническое обеспечение:
Taiwan Forestry Research Institute
Лицензия:
CC-BY-NC 4.0

Описание

The ferns, lycophytes and seed-free vascular plants commonly described as pteridophytes exhibit hyperdiversity in the insular vegetation that often characterizes Asian floras. Despite harboring biodiversity hotspots, these plants and their georegions have been poorly surveyed, particularly in Southeast Asia, where one third of the world's pteridophyte species are concentrated. More than 60 per cent of the approximately 4,500 species lack georeferenced records in GBIF and only 6 per cent have been DNA barcoded.

This project aims to increase the available knowledge on Asian pteridophytes by compiling a georeferenced occurrence dataset that includes images, DNA barcodes and other vouchering information from thousands of recent collections, building on the efforts of the Taiwan Pteridophyte Research Group and its Southeast Asian collaborators. The project team will set up a workflow incorporating next-generation sequencing for 1,500 Asian pteridophyte specimens from selected collections in Taiwan, Vietnam, the Philippines, Malaysia and other Southeast Asian countries that can fill in taxonomic and geographic gaps and represent Asian pteridophyte diversity.

Mobilization of and access to these vouchered and georeferenced DNA-derived records will advance further research into the biogeography of pteridophytes and other terrestrial vegetation and support the development of novel approaches to monitor biodiversity along the spatiotemporal scale, including metabarcoding of the invisible diversity held in soil and spore banks.

Записи данных

Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 1 494 записей.

Также в наличии 1 таблиц с данными расширений. Записи расширений содержат дополнительную информацию об основной записи. Число записей в каждой таблице данных расширения показано ниже.

  • Occurrence (core)
    1494
  • dnaDerivedData 
    1494

Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.

Загрузки

Скачайте последнюю версию данных этого ресурса в формате Darwin Core Archive (DwC-A) или метаданных ресурса в форматах EML или RTF:

Данные в формате DwC-A Скачать 1 494 Записи в English (247 kB) - Частота обновления: not planned
Метаданные в формате EML Скачать в English (9 kB)
Метаданные в формате RTF Скачать в English (8 kB)

Версии

В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.

Права

Исследователи должны соблюдать следующие права:

Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является Taiwan Forestry Research Institute. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Регистрация в GBIF

Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: 6b9f8685-e080-4330-a211-e61ad6bdbe64.  Taiwan Forestry Research Institute отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Taiwan Biodiversity Information Facility.

Ключевые слова

ferns; lycophytes; Southeast Asia; DNA barcode; next-generation sequencing; Taiwan; Vietnam; Philippines; Malaysia; Specimen

Контакты

Кто является создателем ресурса:

Chien-Wen Chen
Data provider
Taiwan Forestry Research Institute
No.53, Nanhai Rd.
10066 Taipei City
TW
+886-2-23039978

Кто может ответить на вопросы о ресурсе:

Li-Yaung Kuo
Data provider
Institute of Molecular & Cellular Biology, National Tsing Hua University
Room 327, 3F, Life Science Building One No.101, Sec. 2, Guangfu Rd., East Dist.
30013 Hsinchu City
TW

Кем заполнены метаданные:

Li-Yaung Kuo
Data provider
Institute of Molecular & Cellular Biology, National Tsing Hua University
Room 327, 3F, Life Science Building One No.101, Sec. 2, Guangfu Rd., East Dist.
30013 Hsinchu City
TW

Кто еще связан с данным ресурсом:

Principal Investigator
Li-Yaung Kuo
Institute of Molecular & Cellular Biology, National Tsing Hua University
Room 327, 3F, Life Science Building One No.101, Sec. 2, Guangfu Rd., East Dist.
30013 Hsinchu City
30013
TW
Publisher
Chien-Wen Chen
Contracted assistant researcher
Taiwan Forestry Research Institute
No.53, Nanhai Rd.
10066 Taipei City
TW
+886-2-23039978

Географический охват

Certain areas among South East Asia.

Ограничивающие координаты Юг Запад [-9,102, 94,922], Север Восток [25,324, 125,156]

Временной охват

Дата начала / Дата окончания 2021-09-01 / 2023-02-28

Данные проекта

Описание отсутсвует

Название BIFA: Biodiversity Information Fund for Asia
Идентификатор BIFA6_010
Финансирование Funded by Ministry of the Environment, Government of Japan.

Исполнители проекта:

Principal Investigator
Li-Yaung Kuo

Методы сбора

TBC

Охват исследования TBC

Описание этапа методики:

  1. TBC

Дополнительные метаданные

Альтернативные идентификаторы 6b9f8685-e080-4330-a211-e61ad6bdbe64
https://ipt.taibif.tw/resource?r=bifa-taif-2022