Improving knowledge of Asian pteridophytes through DNA sampling of specimens in regional collections

Occurrence Specimen
最新バージョン Taiwan Forestry Research Institute により出版 11月 4, 2024 Taiwan Forestry Research Institute
公開日:
2024年11月4日
ライセンス:
CC-BY 4.0

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説明

The ferns, lycophytes and seed-free vascular plants commonly described as pteridophytes exhibit hyperdiversity in the insular vegetation that often characterizes Asian floras. Despite harboring biodiversity hotspots, these plants and their georegions have been poorly surveyed, particularly in Southeast Asia, where one third of the world's pteridophyte species are concentrated. More than 60 per cent of the approximately 4,500 species lack georeferenced records in GBIF and only 6 per cent have been DNA barcoded.This project aims to increase the available knowledge on Asian pteridophytes by compiling a georeferenced occurrence dataset that includes images, DNA barcodes and other vouchering information from thousands of recent collections, building on the efforts of the Taiwan Pteridophyte Research Group and its Southeast Asian collaborators. The project team will set up a workflow incorporating next-generation sequencing for 1,500 Asian pteridophyte specimens from selected collections in Taiwan, Vietnam, the Philippines, Malaysia and other Southeast Asian countries that can fill in taxonomic and geographic gaps and represent Asian pteridophyte diversity.Mobilization of and access to these vouchered and georeferenced DNA-derived records will advance further research into the biogeography of pteridophytes and other terrestrial vegetation and support the development of novel approaches to monitor biodiversity along the spatiotemporal scale, including metabarcoding of the invisible diversity held in soil and spore banks.

データ レコード

この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、1,494 レコードが含まれています。

拡張データ テーブルは1 件存在しています。拡張レコードは、コアのレコードについての追加情報を提供するものです。 各拡張データ テーブル内のレコード数を以下に示します。

Occurrence (コア)
1494
dnaDerivedData 
2834

この IPT はデータをアーカイブし、データ リポジトリとして機能します。データとリソースのメタデータは、 ダウンロード セクションからダウンロードできます。 バージョン テーブルから公開可能な他のバージョンを閲覧でき、リソースに加えられた変更を知ることができます。

バージョン

次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。

権利

研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:

パブリッシャーとライセンス保持者権利者は Taiwan Forestry Research Institute。 This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.

GBIF登録

このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: 6b9f8685-e080-4330-a211-e61ad6bdbe64が割り当てられています。   Taiwan Biodiversity Information Facility によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているTaiwan Forestry Research Institute が、このリソースをパブリッシュしました。

キーワード

ferns; lycophytes; Southeast Asia; DNA barcode; next-generation sequencing; Taiwan; Vietnam; Philippines; Malaysia; Specimen

連絡先

Chien-Wen Chen
  • データ公開者
  • Data provider
Taiwan Forestry Research Institute
  • No.53, Nanhai Rd.
10066 Taipei City
TW
  • +886-2-23039978
Li-Yaung Kuo
  • 研究代表者
  • Data provider
Institute of Molecular & Cellular Biology, National Tsing Hua University
  • Room 327, 3F, Life Science Building One No.101, Sec. 2, Guangfu Rd., East Dist.
30013 Hsinchu City
TW
Li-Yaung Kuo
  • 研究代表者
Institute of Molecular & Cellular Biology, National Tsing Hua University
  • Room 327, 3F, Life Science Building One No.101, Sec. 2, Guangfu Rd., East Dist.
30013 Hsinchu City
30013
TW
Chien-Wen Chen
  • データ公開者
  • Contracted assistant researcher
Taiwan Forestry Research Institute
  • No.53, Nanhai Rd.
10066 Taipei City
TW
  • +886-2-23039978

地理的範囲

Certain areas among South East Asia.

座標（緯度経度） 南 西 [-9.102, 94.922], 北 東 [25.324, 125.156]

時間的範囲

開始日 / 終了日 2021-09-01 / 2023-02-28

プロジェクトデータ

説明がありません

タイトル BIFA: Biodiversity Information Fund for Asia
識別子 BIFA6_010
ファンデイング Funded by Ministry of the Environment, Government of Japan.

プロジェクトに携わる要員:

Li-Yaung Kuo
  • 研究代表者

収集方法

TBC

Study Extent TBC

Method step description:

  1. TBC

追加のメタデータ

代替識別子 6b9f8685-e080-4330-a211-e61ad6bdbe64
https://ipt.taibif.tw/resource?r=bifa-taif-2022