Occurrence

Improving knowledge of Asian pteridophytes through DNA sampling of specimens in regional collections

Dernière version Publié par Taiwan Forestry Research Institute le 23 février 2023 Taiwan Forestry Research Institute
Date de publication:
23 février 2023
Licence:
CC-BY-NC 4.0

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Description

The ferns, lycophytes and seed-free vascular plants commonly described as pteridophytes exhibit hyperdiversity in the insular vegetation that often characterizes Asian floras. Despite harboring biodiversity hotspots, these plants and their georegions have been poorly surveyed, particularly in Southeast Asia, where one third of the world's pteridophyte species are concentrated. More than 60 per cent of the approximately 4,500 species lack georeferenced records in GBIF and only 6 per cent have been DNA barcoded.

This project aims to increase the available knowledge on Asian pteridophytes by compiling a georeferenced occurrence dataset that includes images, DNA barcodes and other vouchering information from thousands of recent collections, building on the efforts of the Taiwan Pteridophyte Research Group and its Southeast Asian collaborators. The project team will set up a workflow incorporating next-generation sequencing for 1,500 Asian pteridophyte specimens from selected collections in Taiwan, Vietnam, the Philippines, Malaysia and other Southeast Asian countries that can fill in taxonomic and geographic gaps and represent Asian pteridophyte diversity.

Mobilization of and access to these vouchered and georeferenced DNA-derived records will advance further research into the biogeography of pteridophytes and other terrestrial vegetation and support the development of novel approaches to monitor biodiversity along the spatiotemporal scale, including metabarcoding of the invisible diversity held in soil and spore banks.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 1 494 enregistrements.

1 tableurs de données d'extension existent également. Un enregistrement d'extension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre d'enregistrements dans chaque tableur de données d'extension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
1494
dnaDerivedData 
1494

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous n'affiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Taiwan Forestry Research Institute. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 6b9f8685-e080-4330-a211-e61ad6bdbe64.  Taiwan Forestry Research Institute publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Taiwan Biodiversity Information Facility.

Mots-clé

ferns; lycophytes; Southeast Asia; DNA barcode; next-generation sequencing; Taiwan; Vietnam; Philippines; Malaysia; Specimen

Contacts

Chien-Wen Chen
  • Publicateur
Data provider
Taiwan Forestry Research Institute
No.53, Nanhai Rd.
10066 Taipei City
TW
+886-2-23039978
Chien-Wen Chen
  • Publicateur
Contracted assistant researcher
Taiwan Forestry Research Institute
No.53, Nanhai Rd.
10066 Taipei City
TW
+886-2-23039978
Li-Yaung Kuo
  • Fournisseur Des Métadonnées
  • Personne De Contact
  • Chercheur Principal
Data provider
Institute of Molecular & Cellular Biology, National Tsing Hua University
Room 327, 3F, Life Science Building One No.101, Sec. 2, Guangfu Rd., East Dist.
30013 Hsinchu City
TW

Couverture géographique

Certain areas among South East Asia.

Enveloppe géographique Sud Ouest [-9,102, 94,922], Nord Est [25,324, 125,156]

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2021-09-01 / 2023-02-28

Données sur le projet

Pas de description disponible

Titre BIFA: Biodiversity Information Fund for Asia
Identifiant BIFA6_010
Financement Funded by Ministry of the Environment, Government of Japan.

Les personnes impliquées dans le projet:

Li-Yaung Kuo
  • Chercheur Principal

Méthodes d'échantillonnage

TBC

Etendue de l'étude TBC

Description des étapes de la méthode:

  1. TBC

Métadonnées additionnelles

Identifiants alternatifs 6b9f8685-e080-4330-a211-e61ad6bdbe64
https://ipt.taibif.tw/resource?r=bifa-taif-2022