OCCURRENCE

Improving knowledge of Asian pteridophytes through DNA sampling of specimens in regional collections

Última versión Publicado por Taiwan Forestry Research Institute en 23 de febrero de 2023 Taiwan Forestry Research Institute
The ferns, lycophytes and seed-free vascular plants commonly described as pteridophytes exhibit hyperdiversity in the insular vegetation that often characterizes Asian floras. Despite harboring biodiversity hotspots, these plants and their georegions have been poorly surveyed, particularly in Southeast Asia, where one third of the world's pteridophyte species are concentrated. More than 60 per cent of the approximately 4,500 species lack georeferenced records in GBIF and only 6 per cent have been DNA barcoded.... Más
Fecha de publicación:
23 de febrero de 2023
Licencia:
CC-BY-NC 4.0

Descripción

The ferns, lycophytes and seed-free vascular plants commonly described as pteridophytes exhibit hyperdiversity in the insular vegetation that often characterizes Asian floras. Despite harboring biodiversity hotspots, these plants and their georegions have been poorly surveyed, particularly in Southeast Asia, where one third of the world's pteridophyte species are concentrated. More than 60 per cent of the approximately 4,500 species lack georeferenced records in GBIF and only 6 per cent have been DNA barcoded.

This project aims to increase the available knowledge on Asian pteridophytes by compiling a georeferenced occurrence dataset that includes images, DNA barcodes and other vouchering information from thousands of recent collections, building on the efforts of the Taiwan Pteridophyte Research Group and its Southeast Asian collaborators. The project team will set up a workflow incorporating next-generation sequencing for 1,500 Asian pteridophyte specimens from selected collections in Taiwan, Vietnam, the Philippines, Malaysia and other Southeast Asian countries that can fill in taxonomic and geographic gaps and represent Asian pteridophyte diversity.

Mobilization of and access to these vouchered and georeferenced DNA-derived records will advance further research into the biogeography of pteridophytes and other terrestrial vegetation and support the development of novel approaches to monitor biodiversity along the spatiotemporal scale, including metabarcoding of the invisible diversity held in soil and spore banks.

Registros

Los datos en este registros biológicos recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 1.494 registros.

también existen 1 tablas de datos de extensiones. Un registro en una extensión provee información adicional sobre un registro en el core. El número de registros en cada tabla de datos de la extensión se ilustra a continuación.

  • Occurrence (core)
    1494
  • dnaDerivedData 
    1494

Este IPT archiva los datos y, por lo tanto, sirve como repositorio de datos. Los datos y los metadatos del recurso están disponibles para su descarga en la sección descargas. La tabla versiones enumera otras versiones del recurso que se han puesto a disposición del público y permite seguir los cambios realizados en el recurso a lo largo del tiempo.

Descargas

Descargue la última versión de los datos como un Archivo Darwin Core (DwC-A) o los metadatos como EML o RTF:

Datos como un archivo DwC-A descargar 1.494 registros en Inglés (247 kB) - Frecuencia de actualización: no planeado
Metadatos como un archivo EML descargar en Inglés (9 kB)
Metadatos como un archivo RTF descargar en Inglés (8 kB)

Versiones

La siguiente tabla muestra sólo las versiones publicadas del recurso que son de acceso público.

Derechos

Los usuarios deben respetar los siguientes derechos de uso:

El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Taiwan Forestry Research Institute. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 6b9f8685-e080-4330-a211-e61ad6bdbe64.  Taiwan Forestry Research Institute publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Taiwan Biodiversity Information Facility.

Palabras Clave

ferns; lycophytes; Southeast Asia; DNA barcode; next-generation sequencing; Taiwan; Vietnam; Philippines; Malaysia; Specimen

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Chien-Wen Chen
Data provider
Taiwan Forestry Research Institute
No.53, Nanhai Rd.
10066 Taipei City
TW
+886-2-23039978

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Li-Yaung Kuo
Data provider
Institute of Molecular & Cellular Biology, National Tsing Hua University
Room 327, 3F, Life Science Building One No.101, Sec. 2, Guangfu Rd., East Dist.
30013 Hsinchu City
TW

¿Quién documentó los metadatos?:

Li-Yaung Kuo
Data provider
Institute of Molecular & Cellular Biology, National Tsing Hua University
Room 327, 3F, Life Science Building One No.101, Sec. 2, Guangfu Rd., East Dist.
30013 Hsinchu City
TW

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Investigador Principal
Li-Yaung Kuo
Institute of Molecular & Cellular Biology, National Tsing Hua University
Room 327, 3F, Life Science Building One No.101, Sec. 2, Guangfu Rd., East Dist.
30013 Hsinchu City
30013
TW
Publicador
Chien-Wen Chen
Contracted assistant researcher
Taiwan Forestry Research Institute
No.53, Nanhai Rd.
10066 Taipei City
TW
+886-2-23039978

Cobertura Geográfica

Certain areas among South East Asia.

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [-9,102, 94,922], Latitud Máxima Longitud Máxima [25,324, 125,156]

Cobertura Temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2021-09-01 / 2023-02-28

Datos del Proyecto

No hay descripción disponible

Título BIFA: Biodiversity Information Fund for Asia
Identificador BIFA6_010
Fuentes de Financiación Funded by Ministry of the Environment, Government of Japan.

Personas asociadas al proyecto:

Investigador Principal
Li-Yaung Kuo

Métodos de Muestreo

TBC

Área de Estudio TBC

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. TBC

Metadatos Adicionales

Identificadores Alternativos 6b9f8685-e080-4330-a211-e61ad6bdbe64
https://ipt.taibif.tw/resource?r=bifa-taif-2022