Описание
The Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium (a.k.a. the EarthBioGenome Project Hong Kong) is a joint effort of eight local universities funded by the Hong Kong University Grants Committee (UGC). This project aims to sequence genomes of local animals, plants, and fungi in the local territory with a state-of-the-art genome sequencer and to form a local network of biodiversity genomic research hub. And is aligned with the aims of the Earth BioGenome Project, which has been described as a moonshot project for biology, aims to sequence, catalogue, and analyse the genomes of all eukaryotes on Earth.
Записи данных
Данные этого occurrence ресурса были опубликованы в виде Darwin Core Archive (DwC-A), который является стандартным форматом для обмена данными о биоразнообразии в виде набора из одной или нескольких таблиц. Основная таблица данных содержит 21 записей.
Данный экземпляр IPT архивирует данные и таким образом служит хранилищем данных. Данные и метаданные ресурсов доступны для скачивания в разделе Загрузки. В таблице версий перечислены другие версии ресурса, которые были доступны публично, что позволяет отслеживать изменения, внесенные в ресурс с течением времени.
Версии
В таблице ниже указаны только опубликованные версии ресурса, которые доступны для свободного скачивания.
Как оформить ссылку
Исследователи должны дать ссылку на эту работу следующим образом:
Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium (2026). Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium. Version 1.0. GigaScience Press. Occurrence dataset. https://ipt.taibif.tw/resource?r=ebphongkong2025&v=1.0
Права
Исследователи должны соблюдать следующие права:
Публикующей организацией и владельцем прав на данную работу является GigaScience Press. Насколько это возможно по закону, издатель отказался от всех прав на эти данные и посвятил их Public Domain (CC0 1.0). Пользователи могут без ограничений копировать, изменять, распространять и использовать работу, в том числе в коммерческих целях.
Регистрация в GBIF
Этот ресурс был зарегистрирован в GBIF, ему был присвоен следующий UUID: e29b2326-5c7a-4455-bbc3-0e21b52be1bd. GigaScience Press отвечает за публикацию этого ресурса, и зарегистрирован в GBIF как издатель данных при оподдержке Participant Node Managers Committee.
Ключевые слова
Occurrence; sequence; Observation; sequence
Контакты
- Metadata Provider ●
- Originator
- Editor
- Editor
https://orcid.org/https://orcid.org/0000-0001-6444-1436
- Point Of Contact
Географический охват
Collected on land and shorelines of Hong Kong Special Administrative Region.
| Ограничивающие координаты | Юг Запад [22,162, 113,821], Север Восток [22,568, 114,478] |
|---|
Таксономический охват
Plants, fungi and animal species collected in Hong Kong.
| Kingdom | Plantae, Fungi, Animalia |
|---|
Временной охват
| Дата начала / Дата окончания | 2004-01-01 / 2023-12-31 |
|---|
Данные проекта
The Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium (a.k.a. the EarthBioGenome Project Hong Kong) is a joint effort of eight local universities funded by the Hong Kong University Grants Committee (UGC). This project aims to sequence genomes of local animals, plants, and fungi in the local territory with a state-of-the-art genome sequencer and to form a local network of biodiversity genomic research hub. And is aligned with the aims of the Earth BioGenome Project, which has been described as a moonshot project for biology, aims to sequence, catalogue, and analyse the genomes of all eukaryotes on Earth.
| Название | Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium |
|---|---|
| Финансирование | This work was funded and supported by the Hong Kong Research Grant Council Collaborative Research Fund (C4015-20EF), CUHK Strategic Seed Funding for Collaborative Research Scheme (3133356) and CUHK Group Research Scheme (3110154). |
| Описание района исследования | Hong Kong |
Методы сбора
Specimens were sequenced with the Pacific Biosciences SEQUEL IIe System, running for 30-hour movies to output HiFi reads. For more information on sample collection, DNA extraction and sequencing see the individual papers for each species to see the methods. https://doi.org/10.46471/GIGABYTE_SERIES_0006
| Охват исследования | Specimens were collected across Hong Kong between 2015 and 2023. |
|---|
Описание этапа методики:
- Hong Kong Biodiversity Genomics Series Page..GigaByte. 2024. https://doi.org/10.46471/GIGABYTE_SERIES_0006
Библиографические ссылки
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Genome assembly of the milky mangrove Excoecaria agallocha, Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.119 https://doi.org/10.46471/gigabyte.119
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Correction to: Chromosome-level genome assembly of the common chiton, Liolophura japonica (Lischke, 1873), Gigabyte, 2025. doi:10.46471/gigabyte.159 https://doi.org/10.46471/gigabyte.159
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Genome assembly of the edible jelly fungus Dacryopinax spathularia (Dacrymycetaceae), Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.120 https://doi.org/10.46471/gigabyte.120
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Chromosomal-level genome assembly of the long-spined sea urchin Diadema setosum (Leske, 1778), Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.121 https://doi.org/10.46471/gigabyte.121
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Chromosomal-level genome assembly of golden birdwing Troides aeacus (Felder & Felder, 1860), Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.122 https://doi.org/10.46471/gigabyte.122
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Genome assembly of the rare and endangered Grantham’s camellia, Camellia granthamiana, Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.124 https://doi.org/10.46471/gigabyte.124
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Chromosomal-level genome assembly and single-nucleotide polymorphism sites of black-faced spoonbill Platalea minor, Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.130 https://doi.org/10.46471/gigabyte.130
Дополнительные метаданные
| Альтернативные идентификаторы | https://ipt.taibif.tw/resource?r=ebphongkong2025 |
|---|