説明
The Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium (a.k.a. the EarthBioGenome Project Hong Kong) is a joint effort of eight local universities funded by the Hong Kong University Grants Committee (UGC). This project aims to sequence genomes of local animals, plants, and fungi in the local territory with a state-of-the-art genome sequencer and to form a local network of biodiversity genomic research hub. And is aligned with the aims of the Earth BioGenome Project, which has been described as a moonshot project for biology, aims to sequence, catalogue, and analyse the genomes of all eukaryotes on Earth.
データ レコード
この オカレンス（観察データと標本) リソース内のデータは、1 つまたは複数のデータ テーブルとして生物多様性データを共有するための標準化された形式であるダーウィン コア アーカイブ (DwC-A) として公開されています。 コア データ テーブルには、21 レコードが含まれています。
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バージョン
次の表は、公にアクセス可能な公開バージョンのリソースのみ表示しています。
引用方法
研究者はこの研究内容を以下のように引用する必要があります。:
Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium (2026). Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium. Version 1.0. GigaScience Press. Occurrence dataset. https://ipt.taibif.tw/resource?r=ebphongkong2025&v=1.0
権利
研究者は権利に関する下記ステートメントを尊重する必要があります。:
パブリッシャーとライセンス保持者権利者は GigaScience Press。 To the extent possible under law, the publisher has waived all rights to these data and has dedicated them to the Public Domain (CC0 1.0). Users may copy, modify, distribute and use the work, including for commercial purposes, without restriction.
GBIF登録
このリソースをはGBIF と登録されており GBIF UUID: e29b2326-5c7a-4455-bbc3-0e21b52be1bdが割り当てられています。 Participant Node Managers Committee によって承認されたデータ パブリッシャーとして GBIF に登録されているGigaScience Press が、このリソースをパブリッシュしました。
キーワード
Occurrence; sequence; Observation; sequence
連絡先
- メタデータ提供者 ●
- 最初のデータ採集者
- 編集者
- 編集者
https://orcid.org/https://orcid.org/0000-0001-6444-1436
地理的範囲
Collected on land and shorelines of Hong Kong Special Administrative Region.
| 座標（緯度経度） | 南 西 [22.162, 113.821], 北 東 [22.568, 114.478] |
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生物分類学的範囲
Plants, fungi and animal species collected in Hong Kong.
| Kingdom | Plantae, Fungi, Animalia |
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時間的範囲
| 開始日 / 終了日 | 2004-01-01 / 2023-12-31 |
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プロジェクトデータ
The Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium (a.k.a. the EarthBioGenome Project Hong Kong) is a joint effort of eight local universities funded by the Hong Kong University Grants Committee (UGC). This project aims to sequence genomes of local animals, plants, and fungi in the local territory with a state-of-the-art genome sequencer and to form a local network of biodiversity genomic research hub. And is aligned with the aims of the Earth BioGenome Project, which has been described as a moonshot project for biology, aims to sequence, catalogue, and analyse the genomes of all eukaryotes on Earth.
| タイトル | Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium |
|---|---|
| ファンデイング | This work was funded and supported by the Hong Kong Research Grant Council Collaborative Research Fund (C4015-20EF), CUHK Strategic Seed Funding for Collaborative Research Scheme (3133356) and CUHK Group Research Scheme (3110154). |
| Study Area Description | Hong Kong |
収集方法
Specimens were sequenced with the Pacific Biosciences SEQUEL IIe System, running for 30-hour movies to output HiFi reads. For more information on sample collection, DNA extraction and sequencing see the individual papers for each species to see the methods. https://doi.org/10.46471/GIGABYTE_SERIES_0006
| Study Extent | Specimens were collected across Hong Kong between 2015 and 2023. |
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Method step description:
- Hong Kong Biodiversity Genomics Series Page..GigaByte. 2024. https://doi.org/10.46471/GIGABYTE_SERIES_0006
書誌情報の引用
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Genome assembly of the milky mangrove Excoecaria agallocha, Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.119 https://doi.org/10.46471/gigabyte.119
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Correction to: Chromosome-level genome assembly of the common chiton, Liolophura japonica (Lischke, 1873), Gigabyte, 2025. doi:10.46471/gigabyte.159 https://doi.org/10.46471/gigabyte.159
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Genome assembly of the edible jelly fungus Dacryopinax spathularia (Dacrymycetaceae), Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.120 https://doi.org/10.46471/gigabyte.120
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Chromosomal-level genome assembly of the long-spined sea urchin Diadema setosum (Leske, 1778), Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.121 https://doi.org/10.46471/gigabyte.121
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Chromosomal-level genome assembly of golden birdwing Troides aeacus (Felder & Felder, 1860), Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.122 https://doi.org/10.46471/gigabyte.122
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Genome assembly of the rare and endangered Grantham’s camellia, Camellia granthamiana, Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.124 https://doi.org/10.46471/gigabyte.124
- Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Chromosomal-level genome assembly and single-nucleotide polymorphism sites of black-faced spoonbill Platalea minor, Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.130 https://doi.org/10.46471/gigabyte.130