Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium

Occurrence
Dernière version Publié par GigaScience Press le févr. 12, 2026 GigaScience Press
Accueil:
https://doi.org/10.46471/GIGABYTE_SERIES_0006
Date de publication:
12 février 2026
Publié par:
GigaScience Press
Licence:
CC0 1.0

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Description

The Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium (a.k.a. the EarthBioGenome Project Hong Kong) is a joint effort of eight local universities funded by the Hong Kong University Grants Committee (UGC). This project aims to sequence genomes of local animals, plants, and fungi in the local territory with a state-of-the-art genome sequencer and to form a local network of biodiversity genomic research hub. And is aligned with the aims of the Earth BioGenome Project, which has been described as a moonshot project for biology, aims to sequence, catalogue, and analyse the genomes of all eukaryotes on Earth.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 21 enregistrements.

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Versions

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Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium (2026). Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium. Version 1.0. GigaScience Press. Occurrence dataset. https://ipt.taibif.tw/resource?r=ebphongkong2025&v=1.0

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est GigaScience Press. En vertu de la loi, l'éditeur a abandonné ses droits par rapport à ces données et les a dédié au Domaine Public (CC0 1.0). Les utilisateurs peuvent copier, modifier, distribuer et utiliser ces travaux, incluant des utilisations commerciales, sans aucune restriction.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : e29b2326-5c7a-4455-bbc3-0e21b52be1bd.  GigaScience Press publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Participant Node Managers Committee.

Mots-clé

Occurrence; sequence; Observation; sequence

Contacts

Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium
  • Fournisseur Des Métadonnées ●
  • Créateur
Coordinator
Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium
HK
Scott Edmunds
  • Editeur
EiC
GigaScience Press
HK
Scott Edmunds
  • Editeur
Editor in Chief
GigaScience Press
HK
https://orcid.org/https://orcid.org/0000-0001-6444-1436
Jerome Hui
  • Personne De Contact
Professor
CUHK
HK
https://www.sls.cuhk.edu.hk/profile/hui-ho-lam-jerome/
https://orcid.org/https://orcid.org/0000-0003-1355-8495

Couverture géographique

Collected on land and shorelines of Hong Kong Special Administrative Region.

Enveloppe géographique Sud Ouest [22,162, 113,821], Nord Est [22,568, 114,478]

Couverture taxonomique

Plants, fungi and animal species collected in Hong Kong.

Kingdom Plantae, Fungi, Animalia

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2004-01-01 / 2023-12-31

Données sur le projet

The Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium (a.k.a. the EarthBioGenome Project Hong Kong) is a joint effort of eight local universities funded by the Hong Kong University Grants Committee (UGC). This project aims to sequence genomes of local animals, plants, and fungi in the local territory with a state-of-the-art genome sequencer and to form a local network of biodiversity genomic research hub. And is aligned with the aims of the Earth BioGenome Project, which has been described as a moonshot project for biology, aims to sequence, catalogue, and analyse the genomes of all eukaryotes on Earth.

Titre Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium
Financement This work was funded and supported by the Hong Kong Research Grant Council Collaborative Research Fund (C4015-20EF), CUHK Strategic Seed Funding for Collaborative Research Scheme (3133356) and CUHK Group Research Scheme (3110154).
Description du domaine d'étude / de recherche Hong Kong

Méthodes d'échantillonnage

Specimens were sequenced with the Pacific Biosciences SEQUEL IIe System, running for 30-hour movies to output HiFi reads. For more information on sample collection, DNA extraction and sequencing see the individual papers for each species to see the methods. https://doi.org/10.46471/GIGABYTE_SERIES_0006

Etendue de l'étude Specimens were collected across Hong Kong between 2015 and 2023.

Description des étapes de la méthode:

  1. Hong Kong Biodiversity Genomics Series Page..GigaByte. 2024. https://doi.org/10.46471/GIGABYTE_SERIES_0006

Citations bibliographiques

  1. Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Genome assembly of the milky mangrove Excoecaria agallocha, Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.119 https://doi.org/10.46471/gigabyte.119
  2. Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Correction to: Chromosome-level genome assembly of the common chiton, Liolophura japonica (Lischke, 1873), Gigabyte, 2025. doi:10.46471/gigabyte.159 https://doi.org/10.46471/gigabyte.159
  3. Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Genome assembly of the edible jelly fungus Dacryopinax spathularia (Dacrymycetaceae), Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.120 https://doi.org/10.46471/gigabyte.120
  4. Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Chromosomal-level genome assembly of the long-spined sea urchin Diadema setosum (Leske, 1778), Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.121 https://doi.org/10.46471/gigabyte.121
  5. Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Chromosomal-level genome assembly of golden birdwing Troides aeacus (Felder & Felder, 1860), Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.122 https://doi.org/10.46471/gigabyte.122
  6. Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Genome assembly of the rare and endangered Grantham’s camellia, Camellia granthamiana, Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.124 https://doi.org/10.46471/gigabyte.124
  7. Hong Kong Biodiversity Genomics Consortium, Chromosomal-level genome assembly and single-nucleotide polymorphism sites of black-faced spoonbill Platalea minor, Gigabyte, 2024. doi:10.46471/gigabyte.130 https://doi.org/10.46471/gigabyte.130

Métadonnées additionnelles